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Estructura molecular del ADN

Estructura molecular del ADN. Nucleótido. Base nitrogenada, fosfato.

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Transcripción del video

ya tenemos un vídeo de repaso del adn te recomiendo que lo veas primero pero lo que quiero que hagamos en este vídeo es ver al adn pero más a fondo vamos a hablar acerca de la estructura molecular del adn y vamos a empezar recordando el nombre completo de adn ok adn es la abreviación de ácido desoxirribonucleico y voy a escribir cada parte distinta de ese nombre con un color diferente la a viene de ácido y luego tenemos desoxirribonucleico ácido desoxirribonucleico y ahora sí vamos a fijarnos en esta molécula de aquí que es el ácido desoxirribonucleico y vamos a ver a qué corresponden cada una de las partes de este nombre rey adn es ácido desoxirribonucléico aparte de nucleico proviene del hecho de que podemos encontrar al adn en el núcleo de las células eucariotas la parte de ácido vamos a hablar de eso en unos cuantos segundos pero primero quiero decir que cada molécula de adn está compuesta por unas cosas a las que les llamamos nucleótidos cada cadena de adn está compuesta por nucleótidos y como se ven los nucleótidos bueno pues aquí dibujé dos hebras de adn hice un muy buen acercamiento a dos hebras de adn esto de aquí es como la columna vertebral de una de las hebras de adn o también podríamos decir que es como uno de los lados de una escalera de mano y esto de aquí es el otro lado de la escalera de mano mientras que éstos son los peldaños cada uno de estos puentes y vamos a hablar acerca de cuáles son estas moléculas en unos cuantos minutos pero estos son como los peldaños de la escalera ahora un nucleótido déjame se paró por aquí un nucleótido un nucleótido es esto que estoy circulando lo que hay todo esto de aquí es lo que consideramos un nucleótido ese es un nucleótido y está conectado a este otro nucleótido esto que estoy circulando ahora es un nucleótido y de este lado derecho también tenemos un nucleótido a no equivoque más bien es de esta otra forma y luego justo debajo tenemos otro nucleótido así es que aquí dibujados tenemos cuatro nucleótidos estos dos están del lado izquierdo de la escalera y estos dos están del lado derecho de la escalera y ahora sí vamos a pensar en las diferentes partes de cada nucleótido seguramente de las primeras cosas que te saltan a la vista es que los nucleótidos tienen este grupo fosfato por aquí y bueno este otro nucleótido también tiene este grupo fosfato y por aquí hay otro grupo fosfato y otro también cada uno de estos nucleótidos tiene su propio grupo fosfato lo que hay aquí tenemos un grupo fosfato por acá y otro grupo fosfato y de hecho son los grupos fosfato los que hacen que el adn y los ácidos nucleicos sean ácidos y aquí tú puedes llegar y decir me oye espera un momento aquí tú dibujaste a los grupos fosfato con un signo menos y cualquier molécula con una carga negativa atrae protones los absorbe como puede ser que me estás diciendo que este grupo fosfato con el signo menos es un ácido esto más bien se ve como una base a la razón por la que dibujamos este signo menos en las moléculas de adn es porque es tan ácido que si la ponemos en una solución neutra va a perder a sus hidrógenos y de hecho si quisiéramos ser muy formales la molécula de adn tendría a este oxígeno protón ado nay de esta forma al verde gemelo dibujo mejor formalmente nos deshacemos de la carga negativa y este oxígeno está enlazado con un hidrógeno ahora este oxígeno realmente se quiere quedar con estos electrones el oxígeno si puede quedarse con esos electrones y entonces este protón de aquí se va con alguna molécula de agua o algo así ok estamos soltando al protón y por eso es que decimos que es un ácido si el adn no estuviera en una solución neutra tendría a todos sus hidrógenos pero como es muy ácido en el momento en el que lo ponemos en una solución a todos estos hidrógenos si es que son estos grupos fosfatos los que hacen que el adn sea un ácido que entiendo perfectamente que sea un poco confuso porque casi siempre que veas dibujada una molécula de adn la vas a ver con estas cargas negativas pero eso es porque ya perdieron a sus hidrógenos en efecto estamos dibujando la base con jugada pero es de aquí de donde proviene la parte de ácido porque empieza a protón ado al menos en su forma de ácido y después pierde a todos estos hidrógenos nuclear y de ahí es de donde saca el nombre de ácido ahora la siguiente cosa que seguramente vas a notar en estos nucleótidos es este grupo de aquí tenemos aquí este ciclo este anillo y se parece muchísimo a los azúcares y bueno eso pasa porque es un azúcar este azúcar es un azúcar de 5 carbonos lo tengo dibujado aquí en su forma de cadena lineal y se llama ribosa ribosa y lo tenemos aquí en su forma de cadena lineal pero como la mayoría de los azúcares también lo podemos tener en su forma cíclica de hecho puede tomar muchas formas cíclicas diferentes pero la que es más comúnmente descrita es la que tenemos por aquí abajo claro que para describirla bien tenemos que ponerle números a estos carbonos sobre todo porque el número de los carbonos es súper importante cuando estamos hablando de adn y siempre empezamos con el carbono del grupo carbón y lo este carbono es el carbono 1 prima y así nos seguimos este es el 2 prima 3 prima 4 prima y 5 prima y para que se forme la ribosa cíclica el oxígeno del carbono 4 primero utiliza uno de sus dos pares de electrones libres y tenemos aquí un par de electrones libres y el otro par de electrones libres y usa uno de estos dos pares de electrones libres para formar un enlace con el carbono uno prima y de esa forma toda la molécula se dobla y se forma de esta estructura también por eso lo dibujé de esta forma porque realmente se dobla y entonces cuando se forma un enlace entre este oxígeno y este carbono el carbono puede soltar uno de estos enlaces con el oxígeno y ahora el oxígeno puede usar esos electrones para ir y encontrar algún protón por ahí ok para hacer un enlace con un hidrógeno y una vez que pasa todo esto nos encontramos de esta forma y sólo para que quede más claro todo este de aquí es el carbono 1 prima 2 prima 3 prima 4 prima y 5 prima y aquí donde tenemos el doble enlace en este grupo carbón hilo el carbono 1 prima suelta uno de estos enlaces dobles y de esa forma el oxígeno puede formar un enlace con algún protón de hidrógeno ok el carbono uno prima lo encontramos por aquí antes tenía un doble enlace con el oxígeno pero lo soltó y ahora el oxígeno tiene un enlace con este hidrógeno de aquí así es que este protón de hidrógeno es este de acá y por otro lado este enlace verde que dibujamos por aquí entre el carbono 4 primer o bueno más bien entre el oxígeno que está enlazado con el carbono 4 prima y ahora si el carbono 1 prima este enlace que tenemos por aquí este oxígeno es este oxígeno que tenemos aquí y observa este oxígeno está enlazado al carbono 4 primero como a crear pero ahora también está enlazado al carbono 1 prima y antes también estaba enlazado con un hidrógeno pero fácilmente podemos perder a este protón de hidrógeno con alguna molécula de agua que pase por allí se lleve a este protón y se convierta en una molécula de idron yo y ahora en total aquí estamos tomando un protón de hidrógeno de la solución y aquí estamos regresando un protón de hidrógeno a la solución así es que no le estamos ni quitando ni agregando nada a la solución y así es como formamos la estructura cíclica de la ribosa y esta estructura se parece muchísimo a estas estructuras que tenemos aquí en las moléculas de adn y bueno de hecho podemos encontrar exactamente esta estructura en las moléculas de a en los ácidos ribonucleicos ahora porque no son exactamente iguales bueno pues aquí es donde nos podemos preguntar por qué tenemos el prefijo de shock si en el ácido desoxirribonucleico a que nos estaremos refiriendo cuando decimos desoxirribonucleico podemos empezar por aquí con una molécula de ribosa y si llegáramos a perder alguno de estos oxígenos entonces tendríamos una desoxirribonucleico átomos de los cuales cuatro son carbonos y tienen una estructura muy parecida a lo que tenemos por acá aunque los hidrógenos y carbonos están todos aquí implícitamente eso sí lo hemos visto un montón de veces en cada uno de estos vértices donde se juntan dos líneas dos enlaces tenemos un carbono y además también cuando tenemos por ejemplo un vértice que se acabe en un puntito ahí también tenemos un carbón y bueno los hidrógenos también están ahí implícitamente ahora si nos ponemos a comparar estas dos moléculas podemos ver por aquí que este tiene un grupo o h en este carbono mientras que este carbono de aquí en lugar de tener ese grupo o h implícitamente sólo tiene este hidrógeno bueno de hecho ok aquí este carbono tiene este otro hidrógeno también y este carbono tiene este otro hidrógeno también pero este carbono ya no tiene un grupo o h por acá así es que perdió un oxígeno y por lo tanto es una de sox y arribos a ok la desoxirribonucleico no tiene el oxígeno que está enlazado con el carbono 2 prima así es que si tenemos una molécula de estas y nos deshacemos del oxígeno del carbono 2 primero obtenemos una esta es una de sox y rebosa desoxirribonucleico estas partes de aquí a las que les llamamos las bases nitrogenadas great esta es una base nitrogenada base nitrogenada y hay varios tipos de bases nitrogenadas aunque hay aquí también tenemos otra base de nitrógeno de distinta y esta de aquí también es otra base de nitrógeno de distinta y observa esta base nada más tiene un anillo esta también tiene únicamente un anillo pero esta otra base nitrogenada ahora tiene dos anillos y esta otra de aquí también tiene dos anillos y bueno tenemos diferentes nombres para cada una de estas bases nitrogenadas a la categorización de estas bases nitrogenadas que tienen los anillos les llamamos purinas así es que de estas bases nitrogenadas si hay una que tiene dos anillos les llamamos purinas pero si tienen únicamente un anillo como en estas dos bases un anillo decimos que son pir y medinas líneas y ahora en particular estas dos bases estas 2 purinas la de aquí arriba se llama adenina y bueno ya hemos visto cómo se unen por pares en el vídeo de introducción del adn pero bueno esta base de aquí es la adenina a de nivel y por acá tenemos la guanina y luego por aquí tenemos estas dos bases nitrogenadas que tienen un solo anillo y por lo tanto son piri midi nash ahora la base piri medina de aquí arriba es la timina timina si estamos hablando del adn porque si estuviéramos hablando de la rn tendríamos que hablar del brasil pero no estamos hablando del adn y entonces es la timina y finalmente esta base nitrogenada de aquí es la citosina de tocina y también podemos ponernos a ver cómo se atraen la timina se enlaza con la adenina y la citosina se enlaza con la guanina ahora como sucede en esos enlaces como están formando los peldaños de esta escalera de adn como se están enlazando la forma en la que estas bases nitrogenadas forman los peldaños de la dm la forma en la que se atraen mutuamente es a través de los famosos puentes de hidrógeno y estos funcionan porque el nitrógeno es un átomo muy electro negativo y entonces al estar enlazados con hidrógenos van a tener una carga parcial negativa y cada uno de esos hidrógenos va a tener una carga parcial positiva y por otro lado el oxígeno como hemos dicho siempre el oxígeno también es muy electro negativo y por lo tanto también tiene una carga parcial negativa y entonces el oxígeno con su carga parcial negativa va a sentirse muy atraído por la carga parcial positiva del hidrógeno y así es como se forma el puente de hidrógeno y lo mismo va a pasar con este hidrógeno de aquí ok porque este hidrógeno está enlazado con un nitrógeno que es muy electro negativo y entonces está abrazando mucho a los electrones de este enlace por lo que el hidrógeno tiene una carga parcial positiva este nitrógeno de aquí también tiene una carga parcial negativa porque es muy electrón negativo y está abrazando muy fuertemente a todos los electrones de estos enlaces entonces hay una fuerte atracción entre este hidrógeno y este nitrógeno formándose un puente de hidrógeno y lo mismo sucede más abajo por aquí tenemos un hidrógeno cuyos electrones están siendo muy abrazados por este nitrógeno entonces el hidrógeno tiene una carga parcial positiva y también tenemos aquí un oxígeno con una carga parcial negativa entonces se van a sentir muy atraídos mutuamente lo mismo sucede entre este nitrógeno y este hidrógeno y también lo mismo sucede entre este oxígeno y este hidrógeno y es por eso que siempre se juntan la citosina y la guanina y la timina y la adenina y también hablamos un poquito de eso en el vídeo de introducción al adn