Coenzimas y cofactores de las enzimas

hemos pasado ya un par de vídeos hablando de enzimas y lo que quiero hacer en este vídeo es entrar en un poco más de detalle y enfocarnos en algunos de los factores que ayudan a las enzimas y como recordatorio las enzimas están ahí para ayudar a que las reacciones procedan a bajar sus energías de activación para hacer que las reacciones ocurran con más frecuencia o que sucedan más rápido ya hemos visto ejemplos de enzimas y sólo para que quede más claro a veces en un libro de texto verás una enzima de esta forma verás un dibujo como este y le van a llamar a esto la enzima y luego van a decir que está actuando sobre algún tipo de sustrato por aquí y esto es bueno para dar una idea de lo que ocurre la idea de un sustrato embonando con una enzima así pero en realidad así no es como se ve en un sistema biológico tenemos que recordar que cuando se habla de enzimas se está hablando de proteínas ahora bien también existen este tipo de enzimas de arn llamadas ribosomas pero por lo general cuando estamos hablando de enzimas tendemos a estar hablando de proteínas y nos pasamos mucho tiempo hablando de como las proteínas son estas estructuras estos polipéptidos y todas las cadenas laterales de los diversos aminoácidos que pliegan a las proteínas en todo tipo de diferentes maneras así que un dibujo más adecuado para algo como esto sería esta proteína que está doblada de diferentes maneras quizá tiene algunas hélices alfa aquí y tal vez tiene algunas láminas beta por aquí y el sustrato podría hacer algún tipo de molécula que se incrusta en la proteína y vemos algunos ejemplos por aquí esto es en realidad un modelo de la exo quinasa y se puede ver un poco del atp justo ahí y es un poco más difícil de ver la glucosa que va a ser fosforilada esta reacción está siendo facilitada por esta gran estructura proteica 'likes' o quinasa en lo que nos vamos a enfocar en este vídeo es que cuando hablamos de una enzima estamos hablando de proteínas estamos hablando de una cadena de aminoácidos pero a menudo hay otras partes de la enzima que no son oficialmente proteínas incluso vimos que cuando hablamos de exo quinasas cuando hablamos de la fosforilación de la glucosa dijimos que la forma en que disminuye la energía de activación es mediante estos iones de magnesio positivos estos iones de magnesio positivos que permiten mantener a los electrones en los grupos fosfato un poco ocupados y alejarlos de modo que este grupo hidroxilo por aquí se pueda unir con este fosfato y no tener interferencia con estos electrones bueno estos iones de magnesio por aquí no son oficialmente parte de la proteína estos son lo que llamamos cofactores así que es posible que tengas un cofactor justo ahí que se enganche con la proteína para convertirse en parte de la enzima y en realidad si se necesita que esto suceda para que la reacción ocurra ya que está desempeñando un papel crucial otro dibujo que puedes encontrar en algún libro de texto se verá algo como esto y dirán bien para que esta reacción tenga lugar si se necesita tener el sustrato pero también se necesita tener el cofactor como factor y una vez más suena como una palabra complicada pero lo que significa es que se trata de una parte no proteica de la enzima es otra molécula o jon o átomo que permite que la enzima realice su función y que no es formalmente una parte de un aminoácido o una parte de una cadena lateral o parte de la proteína es otra cosa que necesita estar allí para ayudar a catalizar la reacción es justo lo que vimos con la ex- equinas a teníamos iones de magnesio que el complejo proteico adquiere y es por eso que cuando la gente habla acerca de sus vitaminas y minerales una gran cantidad de vitaminas y minerales que necesitamos en realidad actúan como cofactores para las enzimas y así puedes ver en este dibujo de aquí estos son los bienes de magnesio en color verde y estos son cofactores estos son dos factores así que um cofactor es una parte no proteica de la enzima y podemos subdividir a los cofactores aún más podemos dividirlos en con factores orgánicos y cofactores inorgánicos hemos visto a los cofactores inorgánicos una gran cantidad de ellos son guiones verás iones de magnesio verás iones de sodio iones de calcio verás todo tipo de cosas que actúan como cofactores muchas veces para distraer a los electrones o para mantenerlos ocupados de manera que el sustrato pueda acercarse pero también hay cofactores orgánicos también puede haber moléculas orgánicas recuerda que las moléculas orgánicas son aquellas que están compuestas principalmente por cadenas de carbono y a los cofactores que son moléculas orgánicas los llamamos con enzimas en cimas y hay un montón de ejemplos de ccoo enzimas este de aquí es la enzima lactato deshidrogenasa y tiene una coenzima y verás esta coenzima muy seguido si estudias biología es enea de justo aquí y esta no es sólo un guión es una molécula y está compuesta principalmente por carbono y es por eso que decimos que es orgánica y no es formalmente parte de la proteína no es parte de los aminoácidos que componen a la proteína y eso es lo que hace que sea un factor y ya que es una molécula orgánica la llamamos coenzima com encima pero como cualquier factor su papel es permitir que la enzima desarrolle su función que es facilitar una reacción y esta coenzima en particular enea de que vas a ver mucho ayuda a facilitar la transferencia de iones y duro los iones hidruro rara vez existen por sí mismos ya que es un hidrógeno con un electrón extra por lo que tiene una carga negativa por lo que permite la transferencia de este grupo a partir de un sustrato o a un sustrato y eso ocurre debido a que en él puede aceptar una unión y duro y convertirse en n ade h y si quieres ver su estructura con más detalle que en realidad es fascinante probablemente voy a hacer todo un vídeo acerca de n a d lo que puede hacer esta molécula es recoger el and johnny duro por aquí en este carbono y formar otro enlace con el hidrógeno y te mostraré el mecanismo completo en otro vídeo ya que el objetivo de este vídeo es ver co enzimas sin embargo vemos estos patrones a lo largo de la biología porque el nombre nicotina me da adenina y nucleótido describe exactamente lo que es la nicotina me da es esta parte de la molécula y esta es la parte que puede aceptar un hidruro o donar un hidruro por lo que se podría decir que es la parte activa de la molécula adenina vemos adenina en el adn en el arn y en el atp por lo que esta es nuestra buena amiga adenina justo aquí y dice un nucleótido porque en realidad tenemos dos nucleótidos unidos a través de sus grupos fosfatos y hay un par de maneras interesantes de pensar en esto tienes una adenina por aquí tienes una ribosa tienes un grupo fosfato y si solo miras esta parte por aquí justo aquí este podría ser un componente básico del arn si hubiera una adenina justo ahí y si incluimos todo esto permítanme borrar esta parte si se incluye todo esto esto es a dp y la razón por la que se llama de nucleótido es que también se puede dividir hacia el otro lado podemos decir muy bien tenemos un nucleótido que tiene nicotina me da por aquí por lo que este es uno de los nucleótidos y después el otro nucleótido está justo aquí el que tiene adenina es por eso que se les llama de nucleótidos así que espero que esto haga del inea de una molécula menos misteriosa la vamos a ver a detalle en el futuro pero me gusta analizarla porque tiene todos estos componentes que se pueden encontrar una y otra vez los ves en el atp los ves en el arn una y otra vez pero este no es el único factor o coenzima hay muchos muchos otros de hecho cuando la gente te aconseja tomar tus vitaminas y minerales tiende a hacer porque son cofactores la vitamina c es un factor muy importante que está involucrado con las enzimas aquí tenemos dos modelos diferentes de la vitamina c tenemos un modelo de espacio lleno y aquí hay un modelo de barras y esferas de la vitamina c el ácido fólico una vez más hay dos modelos diferentes y estos son co enzimas que trabajan de manera similar si tenemos una proteína por aquí que como sabemos es una estructura muy compleja y tenemos algunos 2 que serían nuestros reactivos que necesitan de la enzima para poder llevar a cabo su reacción la enzima cataliza la reacción pero entonces podríamos tener algunos guiones y puedes ver a los iones como cofactores y podríamos tener con factores orgánicos como la vitamina c o algunos otros de los que hemos hablado que también están involucrados y ayudan a facilitar la reacción y una vez más a veces puede ser que ayuden a estabilizar la carga a veces pueden actuar como aceptar eso donadores de electrones o toda una serie de cosas diferentes de hecho pueden actuar como parte del mecanismo de reacción