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Contenido principal

Introducción a los aminoácidos

Los aminoácidos y el dogma central de la biología molecular. Grupos amino y carboxilo, cadenas laterales y zwitteriones.

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Transcripción del video

el adn recibe mucha atención por ser donde se almacena la información y merece toda esa atención porque si no tuviéramos adn no habría forma de mantener esa información que hace que nosotros seamos nosotros y que hace que otros organismos sean esos otros organismos y el adn tiene algunas propiedades muy interesantes por ejemplo el adn se replica a sí mismo y vemos eso a profundidad en algunos otros vídeos si es que adn produciendo más adn a eso le llamamos replicación ahora el poder replicarse a sí mismo no es suficiente para crear a un organismo para producir un organismo de alguna forma tienes que tomar toda esa información en el adn y producir cosas como moléculas estructurales enzimas moléculas de transporte y moléculas de comunicación las cuales hacen el trabajo del organismo y el primer paso de este proceso que por cierto ya lo vimos en algún vídeo pero el primer paso es ir del adn al en el en particular al a rn mensajero y este proceso se llama transcripción transcripción y ya hemos visto con mucho detalle este proceso en algún otro vídeo y después nos vamos con éste a rn mensajero a los ribosomas donde el cnt by por algunos aminoácidos para formar proteínas entonces partimos del a rn y hacemos la traducción y esto de la traducción se hace en conjunto con el cnt y los aminoácidos así es que vamos a poner por aquí tenemos el rn mensajero más el a n de más aminoácidos que lo estamos escribiendo de un color más llamativo porque este es el tema principal del vídeo pero bueno con el cnt y los aminoácidos podemos construir proteínas las cuales están formadas por cadenas de aminoácidos y son justo las proteínas las que hacen una muy buena parte del trabajo del organismo las proteínas no son otra cosa que cadenas de aminoácidos aunque bueno algunas veces son múltiples cadenas de aminoácidos por ejemplo podríamos tener aquí un aminoácido con otro aminoácido y después uno de estos otros aminoácidos y así nos seguimos así es que tenemos puras cadenas de aminoácidos y dependiendo de las propiedades de estos aminoácidos y la forma que puede llegar a tomar esta proteína y cómo interactúa con su ambiente estas proteínas pueden tener todo tipo de funciones desde formar parte de tu sistema inmune podrían ser anticuerpos podrían ser podrían ser hormonas de comunicación como la insulina también están involucradas en la contracción muscular por ejemplo la actina el amio cine y de hecho tenemos un fascinante vídeo al respecto pero bueno las proteínas también transportan el oxígeno la hemoglobina es una proteína así es que por lo menos lo que yo pienso es que las proteínas hacen mucha parte del trabajo del organismo el adn contiene toda la información pero una muy buena parte del trabajo que hace el organismo lo hacen las proteínas y como acabamos de decir los bloques de construcción de las proteínas son los aminoácidos así es que nos vamos a enfocar en estos un poquito por aquí arriba tenemos algunos ejemplos de unos aminoácidos hay 20 aminoácidos comunes pero depende de qué organismo esté observando puede haber algunos cuantos más que teóricamente podría haber muchos más pero en la mayoría de los sistemas biológicos hay 20 aminoácidos en común para los cuales el adn tiene su código y estos que tenemos aquí son dos de ellos si es que vamos a observar los vamos a ver que tienen en común estos dos como podemos ver estos dos tienen en común y bueno de hecho este también que es como que la forma general de un aminoácido pero todos estos tienen un grupo amino por aquí y de hecho por eso les decimos a mí no a los aminoácidos que ellas si es que tenemos un grupo amino por aquí y aquí tú tal vez puedes decir oye pero estás diciendo que son amino ácidos donde quedó la parte de ácido bueno pues esta parte proviene de este grupo car box y lo de aquí y por eso le llamamos ácido no crear porque este grupo car box y lo es así dick o le gusta donar un protón y luego por aquí en medio tenemos un carbono al cual le llamamos el carbono alfa a este le llamamos el carbono alfa y este carbono alfa tiene un enlace con un grupo am y no tiene otro enlace con un grupo car box y lo un enlace covalente con un hidrógeno y ahora aquí es de donde vienen todas las variaciones de los distintos aminoácidos por supuesto hay algunos casos en los que la diferencia proviene en cómo es este nitrógeno de aquí pero la mayoría de las veces la variación entre los aminoácidos depende de qué es lo que tengamos aquí en este cuarto enlace covalente con el carbono alfa por ejemplo aquí en la serina la cadena lateral es un alcohol y por ejemplo aquí en la velina tenemos un hidrocarburo bastante puro aquí tenemos una cadena lateral de hidrocarburo generalmente nos referimos a estas cadenas laterales como una r y estos grupos r tienen un papel muy importante a la hora de determinar la forma de la proteína como interactúan con su medio ambiente y qué tipo de cosas pueden hacer ahora incluso simplemente con estos ejemplos se puede ver cómo estas cadenas laterales se pueden comportar de diferentes formas esta de aquí tiene una cadena en lateral de alcohol y sabemos que el oxígeno es súper electro negativo que le encanta abrazar a todos los electrones y bueno es increíble todo lo que uno puede deducir de química e incluso de biología con la simple electro negatividad de las moléculas así es que al oxígeno le encanta abrazar electrones por lo cual vamos a tener una carga parcial negativa por aquí el hidrógeno no es muy electro negativo sobre todo si lo comparamos con el oxígeno por lo cual sus electrones van a estar siendo abrazados por el oxígeno y vamos a tener una carga parcial positiva por aquí y entonces aquí tenemos polaridad y por lo tanto va a ser hidrofílico al menos esta parte de la molécula va a poder interactuar y se va a sentir atraído por el agua y si comparamos esto con lo que tenemos por aquí aquí tenemos una cadena lateral de hidrocarburo que no tienen nada de polaridad y por lo tanto va a ser hidrofóbica pero fóbica así es que cuando empezamos a hablar de la estructura de las proteínas y de cómo esta estructura está influenciada por las cadenas laterales de sus aminoácidos cómo te puedes imaginar estas partes de la molécula que son hidrofóbicas estas partes de la proteína que tienen cadenas laterales hidrofóbicas se van a querer ir al interior de la proteína si estamos en una solución acuosa mientras que las hidrofílicas van a querer irse al exterior y luego también puedes tener cadenas laterales que son muy estorbosas y pueden hacer que sea muy difícil compactar a la molecular y hay otras cadenas laterales que son muy pequeñas y bonitas que hacen que todo sea súper fácil de compactar así es que estas cosas realmente ayudan a definir la forma y bueno vamos a hablar mucho más de esto cuando estemos hablando acerca de la estructura mientras tanto podemos preguntarnos oye y estas cosas cómo se conectan y también vamos a entrar en mucho más detalle en algún otro vídeo pero si por ejemplo tenemos aquí serín y luego tenemos valina por aquí se conectan a través de una cosa a la que le llamamos enlace pep típico y un péptido es el término para describir a dos o más aminoácidos conectados así es que esto de aquí sería un péptido y bueno este enlace de aquí no es tan grande vamos a dibujar lo más pequeño aunque aquí tenemos la serina y por aquí está la gallina y pueden formar un enlace peptídicos y este sería el péptido más pequeño que se puede formar ok sería un péptido este es un enlace pep típico y se va formando esta cadena se vuelve un polipéptido conforme agregas más y más y más aminoácidos hasta que se puede formar una proteína o puede ser una parte de una proteína que hace todo este tipo de cosas ahora una cosa más de la que yo quiero hablar es que estos aminoácidos de aquí los dibujé como te los vas a encontrar en cualquier libro de texto sin embargo si están en una solución que tiene el ph del cuerpo humano no que el ph adentro de tu cuerpo ok si tenemos un p h en un rango entre 7.2 y 7.4 lo que sucede es que este grupo car box y lo lo más probable es que nos lo encontremos des protón ado lo más probable es que ya no tenga a este hidrógeno de aquí vamos a tener una mayor concentración de aminoácidos en los que este grupo car box y lo va a estar desprotegido así es que en las condiciones del cuerpo humano lo más probable es que este oxígeno se haya quedado con esos dos electrones y ahora tiene una carga negativa dejó que se fuera del protón del hidrógeno pero se quedó con su electrón así es que de este lado se ve así pero por otro lado por acá en el grupo a mí no también cuando tenemos el ph del cuerpo humano es probable que el nitrógeno se haya quedado con algún otro protón por ahí ok el nitrógeno aquí tiene un par de electrones libres y puede usar ese par para quedarse con algún otro protón de hecho si tenemos el ph del cuerpo humano vamos a encontrar una concentración más de aminoácidos en los que el nitrógeno tiene otro protón ok así es que por aquí vamos a poner que el nitrógeno uso sus dos y electrones libres para quedarse con otro protón y por lo tanto ahora tiene una carga positiva así es que algunas veces te vas a encontrar a los aminoácidos descritos de esta forma y de hecho es una forma más precisa de describir lo que está pasando en el cuerpo humano ok lo que te vas a encontrar en condiciones fisiológicas y además este tipo de moléculas tienen un nombre muy interesante estas moléculas que en total tienen una carga neutra pero que algunas de sus partes tienen una carga de esta forma este tipo de moléculas se llaman su interior ok sweater jon y sweater en alemán significa híbrido mientras que la parte de jong claramente significa que tienen una carga si es que tiene cargas híbridas porque aunque tenga cargas en los extremos la carga total de la molécula es neutra