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Contenido principal
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Formación del enlace peptídico

Transcripción del video

tenemos por aquí dos aminoácidos podemos ver los signos que nos indican que esto en efecto es un aminoácido o tenemos por aquí un grupo a mí no me aporta la parte de amd y no en el nombre de aminoácido y tenemos un grupo cars box y lo por acá que es la parte ácida del aminoácido y aquí en medio tenemos un carbono al que le llamamos el carbono alfa ok lo llevamos a éste el carbono alfa y el carbón o alfa va a estar enlazado con un hidrógeno y con alguna cadena lateral a ésta le llamamos la cadena r1 y en este aminoácido le llamamos la cadena r2 y en lo que nos vamos a enfocar en este vídeo es cómo podemos tomar dos aminoácidos y con ellos formar un péptido y sólo como un recordatorio un péptido péptido es simplemente una cadena de aminoácidos que ellos una cadena de aminoácidos y es que cómo le hacemos para tomar dos aminoácidos y formar un péptido en este caso estamos formando un divertido que es una cadena de dos aminoácidos y los divertidos son los más pequeños de los péptidos pero después podemos seguir agregando por aquí otros aminoácidos y entonces obtendríamos un polipéptido y una forma muy general de observar esta reacción es decir que el nitrógeno usa este par de electrones libres para formar un enlace covalente con este carbono del grupo carbón y lo entonces éste nitrógeno llega y forma un enlace con este carbono del grupo carbón hilo y luego éste hidrógeno y éste oxígeno y este otro hidrógeno se pueden utilizar para formar una molécula de agua que hay para formar una molécula de agua que estos dos aminoácidos están dejando ir si es que en esta reacción terminamos con que el nitrógeno tiene un enlace covalente con este carbono y más liberamos una molécula de agua y justo porque estamos librando esta molécula de agua al igual que como hemos visto en muchas otras reacciones justo como se está liberando esta molécula de agua decimos que es una reacción de condensación o una síntesis por deshidratación reacción de condensación o también conocida como síntesis por deshidratación y vimos justo este tipo de reacción cuando estábamos juntando glucosas cuando estábamos formando carbohidratos síntesis por deshidratación y bueno yo siempre que veo una reacción de éstas me gusta poder contar las cosas y decir ok está todo muy bien esto se va a enlazar con esto podemos ver el enlace por aquí y voy a soltar estoy esto que en total es h 2 o una molécula de agua pero cómo podemos imaginarnos qué sucede todo esto podemos empujar estos electrones así de esta forma porque no hacemos un poquito de química orgánica avanzada para ver qué es lo que está pasando en el fondo por aquí y eso es justo lo que vamos a hacer ahorita no vamos a llegar a haber un mecanismo de reacción formal pero sí vamos a tener una muy buena idea de qué es lo que está pasando empezamos por aquí el hidrógeno tiene este par de electrones libres el nitrógeno es muy electrónica tivo y por otro lado tenemos aquí este carbono que está enlazado con dos oxígenos los oxígeno son más electro negativos que los carbono así es que estos oxígeno se están abrazando a todos estos electrones por lo que éste microgen o tal vez quiera hacer algo que en química orgánica nos referimos como ataque núcleo fílmico sobre este carbono de aquí y cuando hace eso si estuviéramos haciendo un mecanismo de reacción más formal tal vez en este momento diríamos que uno de estos enlaces del doble enlace los electrones deseen se van y se quedan con el oxígeno en el momento en que sucede esto y entonces el oxígeno tendría una carga negativa pero luego ese par de electrones libres poder regresar con el carbono y se vuelve a formar el enlace doble y mientras sucede eso este oxígeno de este grupo hidroxilo se va a quedar con estos electrones del enlace que ella esté oxígeno se va a quedar con estos electrones de este enlace y entonces ahora tiene un par de electrones libres extra ok vamos a borrar este enlace este oxígeno ya tenía dos pares de electrones libres pero como se quedó con los electrones de este enlace ahora tiene otro par de electrones libres y por lo tanto tiene una carga negativa y como te puedes imaginar va a llevarse algún protón de hidrógeno en algún momento y por supuesto que se puede llevar cualquier protón de hidrógeno de la solución pero el hidrógeno más conveniente es este de aquí porque como éste nitrógeno va a usar este par de electrones libres para formar un enlace con este carbono entonces va a tener una carga positiva y es que seguramente se va a querer quedar con estos electrones de aquí por lo que fácilmente nos podemos imaginar a este oxígeno utilizando uno de sus pares de electrones libre para quedarse con el protón de hidrógeno de aquí y entonces el nitrógeno se puede quedar con estos electrones del enlace bueno espero que no te haya aparecido demasiado complicado todo lo que hicimos por aquí y a mí y la verdad siempre me encanta pensar en qué es lo que está pasando por aquí podemos ver por aquí que este par de electrones libres del nitrógeno forma un enlace con este carbono forma este enlace naranja de aquí ya este tipo de enlace le llamamos enlace pep típico en la cpep típico y también tenemos la liberación de una molécula de agua tenemos este oxígeno que es este oxígeno y nos podemos imaginar que esté hidrógeno es este hidrógeno de aquí y éste esté acá y entonces ya funciona muy bien tuvo y bueno la primera vez que vi esta reacción me pareció que todo tenía mucho sentido que todo estaba perfecto excepto por el detalle de que si hablamos de niveles de ph fisiológicos los aminoácidos se ven más bien de esta forma en el rango de niveles fisiológicos de ph lo más probable es que nos encontremos a los aminoácidos de esta forma como sweater guiones y déjame escribo esa palabra por aquí suena como una palabra muy divertida twitter y es una sola palabra pero la voy a escribir con dos colores diferentes para identificar cada una de sus partes como podemos ver es un sweater john y qué es lo que eso significa bueno pues la parte de su twitter en alemán significa híbrido así es que estamos hablando de un millón híbrido lo que hay es un millón que tiene distintas cargas en los extremos de la molécula parte de la molécula tienen una carga pero cuando juntamos todas las cargas la molécula en total es neutra así es que en condiciones fisiológicas el grupo a mí no esté nitrógeno de aquí en un extremo del aminoácido el nitrógeno suele tener un protón extra y por lo tanto una carga positiva y por otro lado el grupo cars box y lo suele perder uno de sus protones y tiene una carga negativa y bueno esto que tenemos aquí de hecho está en equilibrio con lo que teníamos antes pero a niveles fisiológicos de ph los aminoácidos suelen tomar esta forma de sweater john y entonces ahora sí cómo le hacemos para pasar de esta forma a un enlace pep típico bueno como nos podemos imaginar aquí este oxígeno acaba de quedarse con un par extra de electrones libre porque dejó que se fuera el protón de hidrógeno que hay entonces el oxígeno tenía originalmente 2 los padres de electrones libre pero ahora tiene un par de electrones libres más que estamos dibujando demorado y bueno tal vez puede llegar y usar este par de electrones libres para quedarse con algún protón que esté flotando por la solución total o es sólo para que las cuentas salgan más fácil puede ser que esté oxígeno choque de la forma adecuada con este hidrógeno de aquí se queda con este protocolo y permite que el nitrógeno se quede con estos electrones de aquí y si llegara a suceder esto entonces al menos este grupo cars box y lo y este grupo a mí no regresarían a tener la forma en que estábamos viendo hace unos cuantos minutos aquí este oxígeno tendría un hidrógeno y entonces formaría un grupo hidroxilo y si el nitrógeno recupera este par de electrones entonces va a ser otra vez nh 2 un grupo a mí normal y por lo menos estas partes de las moléculas se van a ver como las teníamos por acá así es que nos podemos imaginar fácilmente cómo volvemos a obtener este enlace pep típico obtenemos este enlace pep típico y ahora la única diferencia entre el péptido que obtenemos aquí y el anterior es que este efectivo de aquí también es un sweater john es un divertido en su forma de sweater john este grupo cars box y lo de aquí se mantiene habiendo abonado uno de sus protones y por acá este nitrógeno del grupo a mí no sigue teniendo un protón demás así es que seguimos teniendo una carga neta neutra a pesar de que tenemos cargas en ambos extremos en fin espero que te haya agradado este vídeo bush
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