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Estructura terciaria de las proteínas

Transcripción del video

en el video de repaso de la estructura de las proteínas hablamos acerca de los diferentes niveles de la estructura de las proteínas ahí empezamos con la estructura primaria y todo esto es simplemente un rápido repaso pero la estructura primaria es simplemente el orden de los aminoácidos y después de eso nos pusimos a pensar en cómo empiezan a tomar forma en las proteínas y empezamos a hablar acerca de la estructura secundaria y la estructura secundaria se debe a las interacciones del esqueleto proteico ok del esqueleto de los polis péptidos que forman la proteína y eso lo vimos con un poco más de detalle por aquí hablamos acerca de las hojas plegadas beta por aquí tenemos dos esqueletos proteicos que además están orientados en la misma dirección nitrógeno carbono alfacar bono del grupo carbón y lo nitrógeno carbono alfacar bono del grupo carbón hilo y tengo por aquí las cadenas laterales en las cuales los representamos simplemente como grupo serres y también vimos que se forman puentes de hidrógeno entre los dos esqueletos y es que esta es la hoja plegada beta paralela o si los dos esqueletos están orientados en sentidos contrarios entonces tenemos la hoja plegada beta anti paralela ok porque aquí la dirección del esqueleto es nitrógeno carbono alfacar bono del grupo carbón y lo en este esqueleto y en este otro tenemos nitrógeno y carbono del grupo carbón hilo y después carbono alfa entonces están orientados en sentidos contrarios así es que es una hoja pegada beta anti paralela y también se pueden formar estos puentes de hidrógeno o también podemos tener una estructura de hélice alfa en donde tenemos puentes de hidrógeno entre los distintos niveles de la hélice y finalmente llegamos a la estructura terciaria y la estructura terciaria ahora si se trata de las interacciones entre las cadenas laterales y ahora si nos ponemos a pensar en cómo estos grupos se re afectan a la estructura de la proteína y para ayudarnos a pensar un poco más en esto dibujé unas cosas por aquí abajo y bueno nos podemos imaginar sólo para que sea más simple que esta curva naranja de aquí es el esqueleto de nuestro polipéptido y sólo como una especie de repaso rápido podemos ponernos a pensar acerca de la estructura primaria cuál sería la estructura primaria de este polipéptido hay digamos que por aquí tenemos este aminoácido y después tengo este otro aminoácido y luego tengo este otro aminoácido y la secuencia de estos aminoácidos esa es la estructura primaria así es que la secuencia la secuencia es la estructura primaria y después cuando estamos viendo estas interacciones entre el esqueleto proteico esa es la estructura secundaria y aquí seguramente tenemos una hoja pegada beta anti paralela por aquí estos son puentes de hidrógeno gusto aquí entre estos dos esqueletos aunque no dibujo por aquí ni una sola cadena lateral y por acá lo que tenemos es una hélice alfaz donde otra vez tenemos estos puentes de hidrógeno entre los distintos niveles de la hélice pero ahora sí ya vamos a hablar acerca de la estructura terciaria que se trata de cómo interactúan las cadenas laterales por aquí tenemos un ejemplo de estructura terciaria aquí dibuje un montón de cadenas laterales todas estas son aminoácidos valina aunque no dibuja la parte del esqueleto proteico pero el esqueleto está por aquí obviamente nada de esto está en una escala real pero las cadenas laterales del havalina los grupos rr lina son puros hidrocarburos los cuales son hidrofóbicos y una interacción que te vas a encontrar muy comúnmente en estas cadenas laterales hidrofóbica es que estas cadenas hidrofóbicas no les gusta el contacto con el agua y por lo tanto si tú proteína está en una solución acuosa no les va a gustar estar expuestas al agua por lo cual seguramente se van a aglomerar en el centro y eso claro que puede afectar la forma en la que se dobla la cadena polipéptido ica y afecta la forma de la proteína que estas cadenas laterales y aquí pueden ser hidrofóbicas y se aglomeran huyendo del agua estoy dibujando todo esto en la segunda dimensión pero por supuesto las proteínas están en la tercera dimensión lo cual hace que su estructura sea todavía más interesante y en ocasiones difícil de entender o procesar por completo por otro lado también podríamos tener el aminoácido ser ine que tiene un grupo hidroxilo por aquí y cómo esto es polar porque el oxígeno es más electro negativo que el hidrógeno y entonces el oxígeno tiene una carga parcial negativa y el hidrógeno tiene una carga parcial positiva como el grupo hidroxilo es polar eso permite que esta parte de la cadena sea un poco más hidrofílica así es que se puede encontrar por afuera de la proteína en contacto con la solución acuosa o incluso también podría formar algunos puentes de hidrógeno con alguna otra cadena lateral así es que digamos que la cadena sigue por aquí y por cierto para nada estoy dibujando esta escala por ejemplo aquí estoy exagerando por mucho el tamaño de las cadenas laterales pero digamos que de pura casualidad tenemos por aquí otra cadena lateral que tiene un montón de cosas de hecho voy a poner tres puntitos por aquí que de no tenerse un montón de cosas y después tenga un oxígeno que está enlazado con algún otro hidrógeno y entonces tal vez se puede formar por aquí algún puente de hidrógeno y eso también ayudaría a mantener esta estructura por otro lado también podemos tener cadenas laterales que sean y johnny cash podemos tener cadenas que tengan una carga formal por ejemplo digamos que aquí tenemos una cadena lateral rr que tiene una carga positiva y ahora digamos que nuestro esqueleto polipéptido ico da vueltas de ésta forme y por aquí podemos tener alguna otra cadena el lateral que tenga una carga negativa y entonces ésta se van a sentir atraídas mutuamente y vamos a tener un enlace iónico de hecho hasta podemos tener enlaces covalentes entre las cadenas laterales por aquí tenemos uno de esos enlaces covalentes que se encuentran muy comúnmente entre dos aminoácidos cisteína porque estas dosis de íneas tienen un átomo de azufre a ver vamos a separar a una de las distinas aquí tenemos un nitrógeno el carbono al pa y el carbono del grupo carbón y lo entonces esta es una cisterna que bueno en realidad la asiste ine aquí este azufre tiene un enlace covalente con un hidrógeno pero bajo circunstancias adecuadas puede formar un enlace covalente con otro azufre y en este caso es el azufre de la cadena el lateral de otra asisten a y este de aquí se llama en la sedición futuro enlace disulfuro si es que nos podríamos imaginar que aquí tenemos un asistente ine y aquí también podemos tener otra sixtina y sus dos cadenas laterales pueden formar un enlace de sulfuro y este enlace covalente disulfuro ayuda a que estas doce mantengan juntas podríamos hasta decir que las está en grabando en fin espero que esto te ayude a comprender la cantidad de interacciones que suceden que influencian la forma y la estructura de cualquier proteína y finalmente nos vamos a reír eserp ahora que porque también tenemos la estructura cuaternaria que se trata de cómo ponemos varios polipéptidos juntos y toda esta serie de vídeos se tratan de que observes que aunque tengamos la secuencia de aminoácidos no sabemos qué forma o qué interacciones va a tener esa proteína pero toda esa cantidad de diferentes formas de interacción es que pueden tener las proteínas eso es lo que hace que las proteínas sean complejas que sean hermosas y tengan esa increíble habilidad de realizar todas esas funciones como catalizar reacciones funcionando como encima o ser señales en forma de hormonas o hasta proveer la integridad estructural de una célula y también pueden tener muchas otras funciones por ejemplo aquí en el caso de la hemoglobina ayudan a transportar el oxígeno así es que esto de la estructura de las proteínas es un área enorme de investigación porque incluso aunque sepas cuál es la secuencia de aminoácidos no sabemos cuál es la forma de esa proteína y si supiéramos cuál es la forma basándonos en esa forma como podemos utilizarlo para pensar en cómo manipular a esa proteína en distintas formas o cualquier otra cosa que se nos ocurra si es que es un campo de investigación realmente fascinante
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