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Estructura antiparalela de las cadenas de ADN

El ADN está compuesto por dos cadenas de nucelótidos unidas por enlaces de hidrógeno. Las cadenas corren de 5' a 3' en direcciones antiparalelas u opuestas una de la otra.

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  • Avatar leaf green style para el usuario ale.gonzalesdz04
    ¿Se podría definir de igual manera como Estereoisómeros a las desoxirribosas del ADN?
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  • Avatar piceratops sapling style para el usuario Édgar S.
    En el minuto , mencionas que la razón de la estructura antiparalela del DNA está dada por las cargas negativas de los fosfatos que intentan alejarse y por las cargas parciales de las bases nitrogenadas que intentan atraerse. Mi duda: ¿estas orientaciones son estructuradas por enzimas? ¿Y los acomodan así porque es la manera ''más estable''?
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  • Avatar blobby green style para el usuario Mirel Murillo
    ¿Pero porque no se pueden unir la timina y la guanina?
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    • Avatar female robot ada style para el usuario Angelica Chen
      La estructura de todas las bases es lo que determina cuales se pueden conectar. Cada una esta pegada a un lado a la cadena de deoxyribosa que hace la molecula, y en el otro lado se conecta con la base de tipo opuesto. Aunque la union a el azucar es covalente, la union a la otra base es polar. Es menos fuerte, pero igual funciona.

      Estas uniones conectan a un atomo que tiene carga un poco positiva (menos de la carga entera de un proton) con un atomo que tiene carga un poco negativa (menos que un electron). En estas moleculas, eso pasa por el tipo de atomo y la forma en que comparte sus electrones. Lo mismo se ve en agua: los oxigenos se atraen a los hydrogenos de otras moleculas, y poreso el agua tiene tension en la superficie. No se pueden conectar bases de tipo incorrecto porque no tienen los atomos requeridos en los lugares correctos para pegar.
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  • Avatar starky sapling style para el usuario ST
    porque solo se pueden unir los nucleotidos con otros en especifico?
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Transcripción del video

en el vídeo acerca de la estructura molecular del adn vimos que estaba compuesto por dos hebras en las cuales la columna vertebral de cada hebra está compuesta por un grupo fosfato y después un azúcar ok se está alternando entre un grupo fosfato y un azúcar y luego otro grupo fosfato de hecho podríamos dibujarla por acá primero tenemos un grupo fosfato y luego tenemos un azúcar y luego otro grupo fosfato y de una vez voy a dibujar el otro grupo fosfato y enmedio alternándose tenemos un azúcar y como podemos ver pasa exactamente lo mismo en la otra hebra de adn donde empezamos con un grupo fosfato luego tenemos un azúcar luego otro grupo fosfato y otro azúcar y otro grupo fosfato tenemos aquí un azúcar y un grupo fosfato y otro azúcar así es que la otra hebra también se va a ver así ok primero voy a dibujar los grupos fosfatos y en medio tenemos los azúcares y lo que une a estas dos hebras que de hecho podemos pensarlas como los peldaños de una escalera lo que une a estas dos son las bases nitrogenadas complementarias y la razón por las que les llamamos bases nitrogenadas que por cierto se me olvidó hablar de esto en el vídeo pasado es porque estos nitrógeno son muy electro negativos y de hecho se podrían quedar con más protones de hidrógeno estos nitrógeno tienen un par de electrones libres más que en las condiciones adecuadas pueden utilizar para absorber más protones de hidrógeno y ahora muchas personas en este momento se empiezan a preguntar oye por qué es que el adn tiene esta parte de ácido en su nombre si están estos nitrógenos dispuestos a absorber protones y porque decimos que el adn es ácido bueno lo que sucede es que aquí estamos utilizando y compensando la propiedad de base de los nitrógeno a la hora de formar estos de hidrógeno los cuales son los que están manteniendo unidas a estas bases nitrogenadas complementarias formando estos peldaños en esta escalera pero además la razón por la que decimos que es un ácido es porque aquí los grupos fosfatos cuando están protón a dos son ácidos y la razón por la que solemos dibujarlos des protón a dos es porque son tan ácidos que si los colocamos en una solución neutra pierden sus protones en sí es que casi siempre que los vas a encontrar de esta forma en el interior del núcleo de una célula generalmente te los vas a encontrar des protón a dos pero en general los grupos fosfatos son considerados ácidos si estuviera yo hablando acerca de un grupo fosfato en su estado más puro dibujaría yo por aquí un hidrógeno y de hecho ya hablamos de eso en el vídeo acerca de la estructura del adn ok y también borraría esta carga negativa de aquí pero bueno este es una especie de repaso del vídeo anterior claro que como ya empecé aquí hacer algunas abstracciones pues vamos y con esto por aquí tengo yo a la base nitrogenada terminé de color verde así es que esto está enlazado con una timina y la base nitrogenada complementaria de la timina es la adenina ok que estoy aquí y circulando de color naranja esta es la benigna adenina y por aquí podemos ver estos dos puentes de hidrógeno en los cuales tenemos cargas parciales positivas y cargas parciales negativas en los dos extremos del puente de hidrógeno y que se sienten muy atraídas y después vamos al siguiente escalón al siguiente peldaño de la escalera y que es lo que está pasando por acá bueno pues esta base nitrogenada es la citosina citó cine y está enlazada con buen in a esta base nitrogenada es la guanina guanina y de hecho también vimos esto en el vídeo de la introducción al adn y ahora tal vez ahorita podrías decir oye estas dos cebras se ven como que paralelas la una a la otra no y en cierto sentido eso es cierto pero hay un detalle muy interesante del cual tal vez ya te diste cuenta y ese detalle es la orientación de estas hebras y en verdad eso de orientación es la mejor forma de describir lo que está pasando pero se puede notar especialmente cuando nos fijamos en estos azúcares así es que observa atentamente estas desoxirribonucleico bueno al menos estos azúcares del adn derivados de las mientras que si nos fijamos del lado derecho los oxígenos de los anillos están hacia abajo así es que están en orientaciones diferentes aquí el oxígeno está apuntando hacia arriba y aquí el oxígeno está apuntando hacia abajo y bueno para hacer mucho más concretos lo que podemos hacer es utilizar la numeración de estos carbonos y utilizarla para pensar en la orientación de estas moléculas para pensar en la dirección y así tener una forma concreta de describir estas dos direcciones las 10 que pues vamos a enumerar nuestros carbonos este azúcar proviene de la ribosa aquí tenemos estas dos moléculas de ribosa como vimos en el vídeo acerca de la estructura del adn pero aquí en el adn estamos hablando de la desoxirribonucleico dro geno ok por aquí no tenemos este grupo hidroxilo y en tenemos un hidrógeno pero bueno vamos a enumerar estos carbonos y cuando estamos numerando aquí siempre empezamos por el carbono del grupo carbón y lo entonces este es el carbono 1 prima carbono 2 primer 3 prima 4 prima y 5 primer simplemente los número y luego cuando estamos viendo a la desoxirribonucleico este es el carbono 1 prima carbono 1 1er este es el carbono 2 primer 3 primer 4 primer y 5 prima y ahora si quisiéramos numerar estos carbonos pero ya aquí en este diagrama del adn pues este es el carbono 1 1er este es el carbono 2 1er este es el carbono 3 primer el carbono 4 primer y el carbono 5 prima entonces tenemos estos grupos post patos enlazados utilizando estos enlaces fósforo estévez qué es lo que permite que se mantenga unida a esta columna vertebral pero el punto es que estamos yendo de fosfato al carbono 5 primero y luego a través del azúcar estamos viendo al carbono 3 primero de ahí nos vamos a otro grupo fosfato y de ahí a un carbono 5 primer pasando por la molécula de azúcar al carbono 3 prima y a otro grupo fosfato y estos dos números de aquí los sacamos simplemente de la numeración de estos carbonos que se empiezan a numerar a partir del carbono que se encuentra en el grupo carbón y lo de la molécula en su forma de cadena lineal pero podemos ver que aquí en esta línea tenemos fosfato 5 prima 3 prima fosfato 5 primates primera fosfato así es que una forma de describir a esta dirección es decir que estamos yendo de 5 prima a 3 primero podemos poner por aquí que estamos viendo de 5 primero a 3 primero izquierdo pero qué es lo que estamos haciendo del lado derecho bueno pues vamos a enumerar los carbonos de este lado también este es el carbono 1 primer porque esta molécula está invertida con respecto a esta y luego éste es el carbono 2 primer carbono 3 primer 4 prima y 5 prima y también los podemos numerar por aquí este es el carbono 1 prime 2 prime 3 primer 4 primer y 5 primero y entonces tenemos fosfato 3 prima 5 primera fosfato 3 prima 5 prima y fosfato así es que la forma en la que estos azúcares están orientados si vamos de arriba hacia abajo están orientados de tal forma que vamos de tres primeras cinco prima aunque hay del lado derecho estamos viendo de tres primero a cinco prima y si queremos poner una flecha de cinco primera tres primer le tenemos que poner así si es que podríamos decir que estas dos son paralelas pero como están yendo en direcciones opuestas está estructura del adn aunque sean paralelas vamos a decir que son anti paralelas así es que esta es la estructura anti paralela del adn y estas dos cebras son complementarias están definidas la una por la otra la timina se enlaza con la adenina la citosina se enlaza con la guanina o bueno se atraen mutuamente a través de estos enlaces de hidrógeno pero estas dos columnas vertebrales apuntan en direcciones opuestas y otra cosa muy interesante que hay que pensar cuando estamos hablando acerca de la estructura molecular del adn es cómo se forma esta estructura como saben todas estas cosas como orientarse y bueno algo que juega un papel muy importante es el hecho de que estos fosfatos tengan esta carga negativa y todos los átomos que tienen una carga negativa intentan lo mejor que pueden alejarse los unos de otros y por lo tanto como se están tratando de alejar mutuamente terminan orientados de esta forma y bueno además estas moléculas son muy largas realmente muy muy muy largas hemos hablado un poco de eso en el vídeo de introducción al adn incluso hablamos de los largos que son los cromosomas y hablamos de cuántos pares de bases tienen y cómo podemos recordar realmente son muy grandes y estos fosfatos quieren alejarse mutuamente y por otro lado estas bases nitrogenadas quieren estar lo más cerca posible que se sienten muy atraídos mutuamente y forman estos enlaces de hidrógeno así es que todo eso junto es lo que forma esta estructura de adn así es que la molécula de adn es una molécula fascinante podríamos hablar de ella día y noche por mucho tiempo y es realmente impactante las implicaciones que tienen en quiénes somos cada uno de nosotros pero bueno espero que este vídeo te haya un poco de emoción acerca de molecularmente que es el adn